「時の探検隊・闇の探検隊」には出現しなかったダンジョンのまとめです。
探検隊ランクがマスター☆ランクに上がった時に行けるダンジョンです。 主にくさタイプのポケモンが出現します。 「ゆびふりスイッチ」「おんねんスイッチ」が出現するので注意しましょう。 １５Ｆに宝箱が１つあり、「いのちのタネ」などが手に入ります。
探検隊ランクがマスター☆☆ランクに上がった時に行けるダンジョンです。 主にみずタイプのポケモンが出現します。 スイクンからの挑戦状でも来ることになります。 ２０Ｆに宝箱が１つあり、「いのちのタネ」などが手に入ります。
探検隊ランクがマスター☆☆☆ランクに上がった時に行けるダンジョンです。 エスパータイプなどのポケモンが出現します。 ライコウからの挑戦状でも来ることになります。 ２５Ｆに宝箱が３つあり、「いのちのタネ」「ふしぎなグミ」などが手に入ります。
探検隊ランクがギルドマスターランクに上がった時に行けるダンジョンです。 主にほのおタイプのポケモンが出現します。 エンテイからの挑戦状でも来ることになります。 ３０Ｆに宝箱が１つあり、「ＩＱアッパー」が手に入ります。
パッチールのカフェの「プロジェクトＰ」で発見されるダンジョンです。 レベル９０以上の、非常に強いポケモンが出現します。 ５０Ｆに宝箱が４つあり、「じょうかのベール」などの☆☆☆専用どうぐが手に入ります。
ジラーチからの挑戦状を実行すると行けるダンジョンです。 スペシャルエピソード「ビッパのねがいごと」のダンジョンが、１つにつながったものです。 １６Ｆにジラーチがいて、倒せば仲間にできます。
「ゼロのしま なんぶ」よりも厳しい、最難関の追加ダンジョンです。 わな「おんねんスイッチ」「ゆびふりスイッチ」が出現します。 また、「ふっかつのタネ」は非常に出現しにくい（というか出ない？）ようです。 １００Ｆにはアルセウスの像があり、「じくうのオーブ」が手に入るイベントがあります。 （１００Ｆでは操作はできません。）