丹波守護代・内藤貞正の子。弾正忠・備前守。丹波国船井郡八木城主。
永正１７年（１５２０）頃に父・貞正より丹波守護代職を譲られ、父と同様に細川高国に属した。
大永６年（１５２６）１０月に丹波国の波多野稙通・柳本賢治兄弟がそれぞれの居城である八上城・神尾寺城に拠って高国に叛いた際、これを鎮圧するため細川尹賢に従って神尾寺城攻めに従軍したが、１１月初旬には形勢を見て追討軍から離脱し、居城に引き返した。
高国の死後にはその弟・晴国に属したようだが、晴国が重用した多紀郡の国人領主・波多野秀忠との競合からかしだいに晴国との距離は開いていき、天文２年（１５３３）に至って１２代将軍・足利義晴の赦免を受けて細川晴元に属し、丹波守護代に復帰したようである。しかし晴元との関係は良好とは言えず、天文７年（１５３８）１０月に高国残党が蜂起した際にはこれに呼応する動きを見せ、天文１４年（１５４５）には「高国の跡目」と称する細川氏綱に通じて晴元に叛いているが、氏綱の有力な支援者である畠山稙長が同年５月に没したことを契機に反晴元勢力が退勢となると、三好長慶・波多野氏らに鎮圧されている。
天文１７年（１５４８）１０月、細川晴元と決裂した三好長慶が氏綱陣営に参じると長慶に属し、天文２２年（１５５３）９月、長慶の配下武将の松永久秀・長頼兄弟らとともに晴元方の波多野氏を攻めたが、逆に同月１８日、波多野氏を支援する香西元成・三好政勝らに攻められて八木城が陥落、国貞も戦死した。